Popup Assassin Free analiza todas las ventanas que se abren en Internet Explorer, y cierra automáticamente todas las que se consideren publicitarias o no deseadas. El programa tiene dos listas, lista blanca y negra, que agrupan a las ventanas aceptadas y bloqueadas, respectivamente.
Popup Assassin Free está desarrollado en Visual C++, y se trata de una aplicación rápida y muy pequeña, que apenas consume recursos de memoria.